Возможно при установке наперекосяк затянули вал в приводную шестерню, это нужно производить очень очень внимательно и аккуратно, ну конечно возможен дефект в приводной шестерне - посадочное конусное место. после установки ТНВД и установки цепи ГРМ по меткам произвести проворачивание ДВС вручную за венец шкива коленвала и убедиться в том, что приводная шестерня вращается равномерно и не косит.
Буквально вчера была проведена подобная операция по замена ТНВД, кому интересна осталась снятая с неисправностью - вышел из стоя насос подкачки (ремонт обойдется в 10-12 руб.)